Hace cuatro años realicé ese viaje, después de mucho tiempo de "abstinencia" por el tema de seguridad. San Agustín es uno de los mayores tesoros de Colombia, no solo por su riqueza arqueológica, que está muy bien tenida, sino por la maravillosa geografía del sur del Huila. La gastronomía en San Agustín es otro de sus atractivos.
Son un poco mas de 500 Km por lo que puede hacerse en un solo día, aunque recomiendo parar en Neiva para descansar y aprovechar la belleza del paisaje con un viaje mas relajado, sobre todo si va con niños. La carretera está en muy buenas condiciones hasta su destino, por lo que no debe haber inconvenientes por este aspecto. Prepárese a tomar muchas fotografías, los lugares que va encontrar a lo largo de la ruta así lo ameritan. Ya en San Agustín va a encontrarse con muchas opciones de salidas, algunas en camperos otras a caballo que vale la pena tomar: ver el Magdalena en sus inicios, cascadas abruptas, muchas piezas precolombinas es un deleite que, paradójicamente, aprovechan mas los extranjeros que los colombianos.
Para efectos del valor de los peajes, revise estas páginas:
http://www.viajaporcolombia.com/peajes/
http://www.viajaporcolombia.com/peajes/?l=peaje&id=21
Con ese mismo vínculo, vale la pena ver toda la riqueza que ofrece ese departamento, que puede o no incluirse en el viaje que está planeando: el desierto de la Tatacoa, la represa de Betania, Garzón...
http://www.viajaporcolombia.com/huila/
Le recomiendo explorar en la web, donde encontrará mucha información que hará mas fácil y grato el viaje.